哥斯拉掉入三原山(shān )之后(hòu )，日本(běn )过了(🌰)5年(nián )平安(🕟)的日子，但是自卫队(🔧)为了以防(fáng )万一(🛤)，打算以哥斯(🐮)拉(lā )(🥩)的细(xì )胞为成分(fèn )(👋)制(zhì )造对抗哥斯拉的武器(qì )"抗核细菌"(ANB)，以及将之前与(yǔ )(🎿)哥(gē )斯(sī )拉(lā )对战(zhàn )时(✖)被摧毁(🚸)的(de )超(🚑)级(🐶)武器"Super_X"改(gǎi )造成为"Super X2"，此(cǐ )(㊙)时(shí )哥斯拉(💪)在三原山里居然(rán )又(yòu )开(kāi )始活(🔔)动，使(shǐ )(🕙)得日(rì )本关东(⛳)地区地震不断，并(🚴)且使得白(🕯)神博士将自己女(💝)儿细(xì )胞跟(🥊)玫(méi )瑰细胞混合的植物死(sǐ )亡，于是(shì )白神(👪)博(🥋)士(shì )便加入(rù )ANB计划，同(😝)时他将哥斯(sī )拉(🐡)细胞与女儿(ér )细胞(⏲)跟玫(🔤)瑰(guī )细胞混合的(de )植物结合制造(🏃)了不死植物碧奥兰(lán )蒂，但是在(🔫)一次的(🚡)事(shì )件当中碧奥兰蒂被(👛)释放出来(lái )(🎦)并且在芦之(zhī )湖(👚)巨大(⏺)化。此时三原山爆炸，哥斯拉再(🍹)度(⛴)出现(xiàn )，自(🈺)卫(wèi )(⏺)队无法阻挡哥(🔬)斯拉 往东京方(🐌)向移动，后来出动了"Super X2"使哥斯(sī )拉改(gǎi )变移动方向，但(dàn )(🔮)是在(zài )(♟)哥斯拉不(🍏)间断(♈)的攻击之下"Super X2也败下(xià )阵来，但是没有想到哥斯拉此(👎)时却朝着碧(bì )奥兰蒂的(de )所(suǒ )在地(🏫)移动.....