第二集中，尼奥（基(jī )努·里维(wéi )斯 Keanu Reeves 饰）没(méi )有能(🎹)从内(nèi )部(🐉)摧毁“母体(🏴)”，他的(💤)身体在真实世(⏬)界(jiè )的(de )飞船(🌗)上陷于昏(😎)迷，思想却被困在介于“母(mǔ )(🎡)体”和真实世界的(de )中(zhōng )(🛹)间(jiān )地带，这个地(dì )方(fāng )由“火车人”控(🙁)制。墨菲斯（劳伦(lún )(🤯)斯·菲什(🔊)伯(bó )恩 Laurence Fishburne 饰）和(🥎)崔(cuī )妮蒂(🗞)（凯瑞(ruì )-安·(🏂)莫(🙌)斯(sī ) Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了(le )(💠)尼奥(ào )的情况，在守护天使的带领下(xià )， 找到了“火车人”的控制者梅罗纹奇(qí )，经过一番激斗，将(jiāng )尼奥救了出来。　　此时(shí )，电子乌贼部(🐡)队(duì )对(duì )(🤔)锡(xī )(📧)安发起了(⏲)猛(📛)烈(🔤)的攻击，人类组织(💸)所有机甲(jiǎ )(🏃)战士(🏴)展(🚲)开(kāi )顽强的抵抗，形势危(🔫)在旦夕(xī )；尼奥和崔妮蒂驾(🔲)驶(👛)了(le )一艘飞船克服(🍺)重重困难，到达机器城(❓)市(shì )，尼奥终于见到了机器(qì )世(shì )(❄)界(jiè )的(🈺)统治者“机(🈳)器大(dà )帝”，双方(fāng )谈(🚪)判并达成(💛)了协议：尼奥除掉(diào )(🈸)不受(shòu )“母体(tǐ )(🕵)”控制的史密斯，以换取锡安(ān )的和(hé )平。　　在(🍈)“母体(👔)”中(🔮)，尼奥和史(shǐ )密(🍏)斯展(zhǎn )开了关(😄)系人(rén )类生死存(cún )亡的最后决(🥈)斗。