上一部结尾(⛲)，尼(ní )奥(🥇)（基奴(nú )李(lǐ )维斯(🔼) 饰）终于意识到自己(🤢)的能力和使命(🎹)，中弹(🐉)复活后(hòu )，变成了无所(💤)不(😧)能(🎾)的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），舰(👁)长(🙍)墨菲(✳)斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回(huí )到了人类的基地(dì )锡安，受到人们的热烈欢迎(yíng )。　　此时，“母体”决(jué )定(dìng )(😞)先下手为强(🦗)，派出了两(🥎)万(🥔)五(wǔ )千只电子乌贼攻(gōng )击锡(xī )安(ān )(🤸)基地；墨菲(🙀)斯(sī )、尼奥和崔(🈴)妮(🍄)蒂则再(zài )(🤷)次进(🧤)入“母体”，寻找(zhǎo )(👺)“制(zhì )钥者”，准备从内部破坏；而本该(gāi )被(🈁)尼奥消(💹)灭(miè )的特勤史密斯(💍)似(sì )乎出了点问(➡)题(tí )，脱离了(🐨)“母体”的(de )(🌪)控制，拥有可怕的复(🔈)制(zhì )能力，阻碍(ài )尼奥(ào )他(tā )们的(🤥)行动。