晴朗时节，江户川柯南(nán )（高山南 配(pèi )音）和毛利小五郎(🤢)（小山力也(🎗) 配(pèi )音(yīn )）、小(🌰)兰（山崎和佳奈(nài ) 配音(📿)）(🌫)以及(jí )少年侦探团的伙(huǒ )伴(bàn )们(men )(🚤)一同(⚫)来(lái )到京都，他们(men )即将(🎡)登上(🕯)自卫(🙍)队的宙(zhòu )斯盾战舰(jiàn )(🏐)，体(🐖)验(🕌)一(yī )把(bǎ )出(🎿)海作战的感觉，期间还结识了美丽(lì )又有着几(🔊)分神(shén )秘(mì )的女自卫(wèi )队员(yuán )藤(téng )井七(🚨)海（(⏯)柴咲幸 配音(yīn )）。谁知(㊗)快(🥎)乐的氛围很快被(✋)恐慌(🏂)所替代，战舰上突然发现一(🎾)条断(🈴)掉的手臂，消失(shī )的自卫(🕙)队(⛳)员又引(👺)起(qǐ )军方的恐(kǒng )慌与猜测(🚴)。原(🤖)来某国神秘间谍X已(💝)悄悄登上宙斯(sī )盾，伺机(🐾)盗取战(zhàn )舰(➡)上的绝(jué )密(mì )情报。 　　(🌪)为了(🌼)找(zhǎo )出隐(yǐn )藏(cáng )的对(😝)手，柯南(💿)和(hé )(🎥)灰(huī )原哀（林(lín )(🔍)原(yuán )惠美 配音）、阿笠博士（(💸)绪方贤一 配音(🚲)）、服部平次(cì )（堀川亮 配音）以及远山(shān )(🚽)和叶（宫(gōng )村优子 配音(yīn )）通(tōng )力合作，与(👩)间谍展开连番斗智斗勇(😉)的(de )较量……