故事的舞台是互联(⛲)网(wǎng )系统发达的都(dōu )市「DEN CITY」。在那(nà )里有经由(🎹)巨型企业「SOL技术(shù )社」通(😧)过高度(dù )的网络技术构(gòu )筑而成的被称为(wéi )「(🐿)LINK VRAINS」的(de )(💆)VR空间(jiān )。人(rén )们都在那(🛺)个(📞)VR空间中为(🍮)体验(yàn )到全新的决斗而狂热(rè )。可是在「LINK VRAINS」中却(🖲)出现了(le )利(🦗)用决斗来(lái )进行黑客(kè )行(háng )为的谜(mí )(✋)之黑客集(jí )团(🤸)「海诺因骑士(🙉)团(tuán )」。而他们(🍄)的(de )目标是将存(cún )在(🚻)于互(🕙)联(⛳)网的(de )某处(chù )的(🏯)“AI们的世界=电子界”毁(huǐ )灭。然而(❕)在世界受(shòu )到这样的威胁(xié )时，有一名决斗者(zhě )(🌹)站了出来。而(ér )他的(💅)名字(🚶)正是「Playmaker」。在(🔍)那场传奇(📛)的战斗中(zhōng )(📸)，「Playmaker」使用(yòng )压倒(🔙)性的(👄)决斗(🆙)将「海(hǎi )诺因骑士团(tuán )」打倒，成(🔲)功捕(🕕)获了「SOL技术社」和(hé )「海(🧘)诺(nuò )(💅)因骑士团(✖)」都(dōu )想要得手(🚩)的迷之(zhī )(🏸)AI程序。一度拯救了世界(🔍)，然后却突然消(xiāo )声(💛)匿迹了，而他(✒)的名字就(🛃)在互联(lián )(🕵)网的世(📯)界(🐇)中一(yī )瞬(🔍)间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」(🐑)的正(zhèng )体(tǐ )的某位高中(⛱)生藤木(📸)游作，为(wéi )了寻找过(🦄)去发生(🍂)的某件(jiàn )事件(jiàn )的(de )真相，对(🚹)再(zài )次(cì )在「VRAINS」出现(🥈)的「海诺因骑(🥖)士团」展开了(🍆)追击(💍)......  以(yǐ )(🛒)此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的(de )真(zhēn )身，「海诺(nuò )因(🖨)骑士团」盯(🚬)上(🐊)「(📻)Link Vrains」的目(mù )的，以及隐(yǐn )藏在游作过去的真相到底是———(🎅)所有的答案(àn )，都(dōu )在「(🍑)Link Vrains」中