故事发生在一所名(⛲)叫(✒)第3新(📼)东(📒)京(jīng )世立NERV学园中，校长是(shì )严肃又(🎺)寡言的碇原度（立木文彦 配(pèi )音）。作为校长的(de )儿子，碇(🌗)真(zhēn )嗣(sì )(♑)（绪方惠美(⚫) 配音(yīn )(🔸)）感到压力(🛍)很大。于(👁)此(cǐ )同(tóng )时，来自外国的红(hóng )发转学(xué )生明日(rì )香（宫村优(🙁)子(zǐ )(😻) 配(pèi )音），分(🕕)裂(liè )成三个、以姐妹(🚢)的形(📎)式出场的凌波丽（林原惠(huì )美 配音）都给(🌊)碇(dìng )真嗣(🥔)的学(xué )校(🙂)生(shēng )活带来(lái )了(le )翻天(tiān )覆地的(de )变化。此外，在原作中高(⛏)大帅气(👃)的初号机，也(⛳)将(😍)以娇小可爱的形象(🕐)，作为学(🧣)院的一份子出现在(🈁)动(❕)画(huà )中。　　动画(huà )以《新世界福(fú )音战(zhàn )士(🏻)》中的角(🐨)色为(🥋)原型，一(💅)改原作沉(chén )(📟)重严(yán )肃的气氛(fēn )，描述了轻(qīng )松(📧)愉快的校园(📛)生活。制作(🥤)方首次采用了3D的Q版造型，配以实(👄)景(🐖)背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格(gé )。