“闇之书事件”（(⛲)参照(zhào )魔法少女奈(nài )叶A's）的(😘)10年后(hòu )。踏(🤢)入(rù )(🤴)19歳的高町奈(nài )叶(yè )、菲特·T·哈洛温(wēn )、八神疾风(fēng )三人(rén )，怀抱着彼(bǐ )(♑)此(cǐ )(📼)的(de )友情牵(⚫)绊(bàn )、为了追(🎩)求(🤷)各自的梦(mèng )想实(shí )现而加入时空(🛹)管理局，并(🕌)以一(yī )(📞)流魔(mó )导师的(😚)身分(✖)活跃。　　在此(🥀)当中，出现了新(xīn )发现的(🌙)太古(🧚)遗(🚣)产“圣遗晶石(🛑)”（(😞)レリッ(❔)ク(💱)），以及以(㊗)此为目标而出现的谜样机(🙌)械(xiè )兵(bīng )器“共鸣拓发者(zhě )”（ガ(⏰)ジェットドローン）。为了(le )迅(😍)速对应日后被(bèi )称(chēng )为“圣遗晶石事件(jiàn )”的(de )状况(🤘)，八神疾风考虑到设(👊)置能够(gòu )迅速(sù )对(duì )应(🈸)的(de )独立部队的(🐨)必(👪)要性，设(🌪)立了(le )专责处(📟)理与太古(gǔ )(🔈)遗产(chǎn )关连(🎥)任务的特殊部队——“机动六课”。　　另一边，时间回溯到四年(🔙)前。昴(🐖)·中岛在(💣)遭到机场火(⏳)灾卷入而(🍁)几乎丧命(mìng )之际，由于(🍺)奈(🔪)叶的出现而得救。因为(📬)憧憬(jǐng )著如同“自己理想中的(de )形象”一般的奈(nài )叶，昴(mǎo )在(🌲)当晚的满天星空之(zhī )下(xià )，做(⛅)出了“成为管(guǎn )理局的魔导师”的(de )(♊)决定。　　四(🏆)年后(hòu )，经过一番(fān )(🍝)波折而(🕌)顺(🏗)利成为管理局的新进(🍏)魔(mó )导师(⏭)的昴，与训练校时(shí )代的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同挑战魔导(🔰)师的(🏉)升(shēng )格(gé )(📳)试验(yàn )。于远处凝视著两人考(kǎo )试的，分别(bié )(🏫)是认定两人将成为(wéi )“机动(📒)六课”的明(💽)日之星而(ér )投以注意的疾风(🤟)与菲(💦)特、还有(yǒu )奈叶(yè )。在三人的(de )注视(🥘)之中，随着(zhe )宣告(gào )试验开始的ReinForce II（(📩)统御之力zwei）的声音，拉(lā )开了“StrikerS”故(🀄)事的(de )(🚰)序(xù )(💻)幕(🈹)。