“闇之书事(👷)件”（参照魔法少女奈(nài )叶(🍩)A's）的10年后。踏入(rù )19歳的高町(dīng )奈叶(🐉)、菲(fēi )特(🍖)·T·哈洛温(wēn )、八(🎾)神疾风三(⏬)人，怀抱着彼此的友情牵绊(bàn )、为了追(🎩)求各自的梦想实现(xiàn )而加(✳)入(rù )时空管理(lǐ )局(jú )，并以一流魔导师的(😚)身分(fèn )活跃。　　在此(cǐ )当中，出现(xiàn )(🤷)了新发现的太(tài )(📎)古遗产“圣遗晶石”（レリッ(❔)ク(💱)），以及(🌊)以此(🥎)为目标而(🙂)出现的谜样机械兵(🤸)器“共鸣拓(🙀)发者”（ガジェットドローン）。为了迅速对(👺)应(yīng )日后被(bèi )称为(🕐)“圣遗晶(jīng )石(shí )事件”的状(zhuàng )况，八神疾(💹)风考虑(lǜ )到设置(zhì )能够迅速对应的独(🏻)立部(bù )队(duì )的(de )必要性，设立了专责处理与(yǔ )太古遗(yí )产关(guān )连任(rèn )务(wù )的特殊部队(duì )(🤥)——“机(👌)动六课”。　　另一边，时间回溯(📐)到四(🌂)年(🔙)前。昴·中岛在遭(zāo )到机场火(⏳)灾卷入而几乎丧(🕕)命之(👗)际，由(yóu )于奈叶的出现而得救(jiù )。因为(📬)憧(chōng )(✖)憬著如同“自己(🍹)理想中的形象”一(🔮)般的(🈳)奈(nài )叶(yè )，昴(mǎo )在当(dāng )晚(wǎn )的满天星(🖱)空之下，做出(chū )了“成为(🙅)管(guǎn )理局的魔导师”的决定(dìng )。　　四年后，经过一番波(bō )折而(ér )顺(🏗)利成(chéng )为(🔮)管(guǎn )理局的新进魔导师的昴，与训(🖥)练校时(shí )代的(de )伙伴蒂(🥈)雅娜(📸)·兰斯(👅)特共同(tóng )挑战魔(🔂)导师的升格(gé )试验(🚔)。于远处(❗)凝视著两(🏓)人考(🤳)试的，分(fèn )(📛)别(bié )是(😛)认定两(liǎng )人将成为“机(jī )动(📒)六课(kè )(😕)”的明日之星而投(😯)以注意的疾风(🤟)与菲(💦)特、(😇)还(🌟)有奈(nài )(🛥)叶。在三(🧖)人的(❣)注(zhù )视之中，随着宣告试验开始的ReinForce II（统(Ⓜ)御之力(☔)zwei）(🤩)的(🐎)声(shēng )(😍)音，拉(📒)开了“StrikerS”故事(shì )的序幕(mù )。