创圣纪0011年的地球，由于(yú )11年(nián )前的大异变(🕟)，人类丧失了23的(de )人口。　　南极冰(🍖)山溶化，1万(💤)2千年前灭(👋)亡的(de )亚特兰蒂亚(yà )重现于世，拥(yōng )有双翼(yì )(👑)的(de )(🎩)「堕天翅(🎡)族(zú )」苏醒(🙍)了。他(tā )们将生物机械兵器「神话兽」接连送(✖)入人类(lèi )的都(dōu )市，捕(bǔ )获人类，摄(shè )取生体能源「Purana」(🛑)。　　另一方面(miàn )，人(rén )类(lèi )决心反(fǎn )击，从海(hǎi )底遗(✋)迹(🐑)发掘(jué )岀三台(tái )(🌞)组合（hybrid）战斗机(🥫)「Vector Machine」。这是(shì )1万2千(qiān )(⚾)年前，将(jiāng )(🗳)堕天翅(❕)族逼(💹)入灭亡(🥊)绝境(👊)的传说中(🐾)的兵器(qì )(🈸)。Vector Machine经过(🐩)合(💯)体，「机械天(🎥)使Aquarion」即将现身。　　要启(qǐ )动Aquarion，需要能与机(jī )体(tǐ )的(💣)机械生命感(⏳)应和共鸣，称(chēng )为(wéi )「Element」的人(rén )。这要求特别敏(✖)锐的(de )五感和纯(chún )真的(de )(⛴)灵魂，因此十五岁(suì )左(🈳)右(🐈)的少年少女(💕)们被选(🐌)为机(jī )师，集中起来。　　而(🙅)后(🛃)，「机械(🎞)天(🚓)使(📯)Aquarion」合(hé )体的时刻终于到来…