21世纪初，人类将多数(shù )(🥇)人留(liú )在被哥(🍩)斯拉蹂(róu )(🃏)躏(lìn )的地(🕟)球(🕸)上，仅(🕰)使(🤢)被选中(zhōng )的人(🎗)们乘(🆖)上(shàng )恒星间(🌰)移民船·阿拉特拉姆，前(🌫)往能够(gòu )移居的“约(yuē )定(dìng )之地·τ星(xīng )e”。但这(🤷)一(🗄)计划失败，人(🙍)类(💆)只得(dé )再度(dù )返回地(🚥)球。而(ér )长距离(lí )亚空间(😚)航行所引发(🚸)的(🖍)时空歪曲，导致(zhì )人类回到的地方变成(🚣)了“两(liǎng )万年后的地球(qiú )(🖲)”。在这个(🌑)地球，主人公(gōng )·晴男等(🔝)人(✋)在(zài )(🐑)遭(zāo )受哥(🤠)斯拉(🌞)袭击的同时，与(yǔ )埃克西(xī )弗、比(bǐ )尔(ěr )(🤷)沙尔德两(liǎng )种族的异星人共(gòng )同实行谋划了20年的“对(🕯)哥斯拉(🗳)战(zhàn )术”，通过殊(shū )死(🥊)战(zhàn )斗成功(💍)击倒(🐾)了哥斯拉。　　但喜悦并未持(🃏)续多久(🌼)，深藏地下的(😝)真正哥斯拉“哥(🈺)斯拉·地(dì )球”现(xiàn )身了。两(liǎng )万年间持续成(chéng )长生存、身高300米(mǐ )、质量(🐖)超(chāo )(🆙)过10万(🔥)吨，在进(⏳)化成这种姿态的(de )超巨(👗)大哥斯(sī )(🚻)拉压倒(dǎo )(🐂)性(xìng )的破坏力面前，晴男等人落花(😉)流水。　　拯救(💁)了晴男的是(shì )被(🈳)视为人类的残(cán )存(cún )者“弗图亚”之民，米亚娜(💨)。弗图亚是他们在(zài )这个地球首次遇(yù )到的人型(xíng )生命种(zhǒng )族。他们会是人类的子孙(sūn )吗——。“弗图亚(🍗)的(😄)神也被哥斯拉(👡)击破，如(⛱)今只剩下卵(🌽)。挑(tiāo )战(🎇)者、抗(🦄)争者，全部被(bèi )(📳)火焰吞噬而消(xiāo )失(shī )了”面对这(zhè )样的他(🛫)们(men )，晴男回应(yīng )(🦀)道(dào )“这是以人类(📒)的(de )双手夺回地球的最(zuì )后(hòu )机会(😫)了”。　　另一(yī )方面，比尔(ěr )沙尔德(dé )的指挥(huī )官(guān )·(🔘)加尔格，注意到弗图亚使用的箭(jiàn )(🔦)头(tóu )(🔘)是由(yóu )“自律思考金属(shǔ )体(Ⓜ)·纳米金属”所制造(🐎)而欢喜。这(zhè )和21世纪他(⤴)们在(👂)富士山麓作为“对(duì )(🈹)哥斯(🏚)拉决战兵(🍑)器”所开发(fā )、在启(💱)动前遭到破坏的(de )“机械(🐋)哥斯(sī )拉”由同种物(wù )质所构成(🚇)。这(🔄)正是当时(shí )的开发设(shè )备至(zhì )(💃)今仍然残(🤮)存的证明——(📑)。