拥有一头青(qīng )色头(🆓)发(⛲)的男主(zhǔ )角名(📒)字将叫(jiào )作(zuò )深(shēn )井 青(フカイ(🔱)·アオ，这名字在日(rì )语(🥈)中带(dài )有“深青”的(🐮)意义），是(shì )一名13岁(suì )少年(nián )。青的父亲兰顿·(🐿)萨斯顿(Renton Thurston、レントン(📞)·(🎿)サ(🎫)ーストン)行(háng )踪不明，而母亲(qīn )优莱卡(Eureka、(🧚)エウレカ)也(yě )在10年前被(bèi )美军(jun1 )带走了。由于继(💻)承了母亲的特殊(shū )(🏂)基因，使得他(tā )能够(gòu )(🙀)看见人(⛓)眼所不能看(kàn )到的东西，如(🚻)粒径为(⛳)20nm大小的(🎋)光(guāng )粒子，红外线(🤖)、紫外线等等（但(dàn )在(💝)外(wài )太空这一特(👊)殊生理受到限(xiàn )制）。小时与诊疗所里的老医生深(shēn )(🚶)井 敏夫(fū )一同生(🏒)活，现正(🐡)在Generation Blue（蓝(🥅)色世代）中。　　女主角的名(míng )(🐖)字将(jiāng )是阿拉塔·娜露，同样是13岁，是(👗)与青(qīng )(📤)一同成长的(👚)青梅竹马。娜露因为童(tóng )年时的(de )事(shì )故而使拥有”ユタ”的(🔮)力量(犹达，是日本冲(🚪)绳(🐌)以占卜为(wéi )(👼)职业的(de )灵媒师的(🈸)名(míng )称)的(de )眼睛(jīng )醒(xǐng )觉。娜露(👆)有(🔍)能够听(🗒)懂珊(shān )瑚(hú )岩心(🎆)声(shēng )的特异功能，这(👔)是因为(🈺)珊瑚(🔝)岩的(🏁)一部分在她体(tǐ )内成长，从某(mǒu )种(zhǒng )程度上来说她和(🌲)珊瑚(hú )岩存在部分融合，但正是因(🍐)为(🚔)这(zhè )样，导致她(😓)自(🔚)小身体虚(🔡)弱，需(xū )要把氧(🏺)气放入在手上的(de )吸(xī )氧(📒)器，现(xiàn )与父亲、(🌄)妹妹及祖(zǔ )母(😫)一同生活中。　　本作(🔀)的舞(wǔ )台(😎)也设(shè )定在冲绳(🥘)的磐户岛上，当(🚞)时的磐户岛(🖨)正进行(háng )著自(zì )治权回复(⛹)运动(dòng )，但在(Ⓜ)某一天(tiān )，在岛(🚹)上(🚄)出(🤩)现的珊(shān )瑚岩(yán )(📒)受到了宿(xiǔ )敌(dí )(😋)白细胞G-Monster的攻击，而为了保护磐户(🌳)岛，男主角(jiǎo )青与人型IFO（Intelligent Flying Object）相遇，并与G-Monster战斗(🐩)的(🗒)故事(☕)就此展开。