自西(🕕)元20XX年，人(rén )类从肯亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个名叫索哈(hā )尔(Zohar)的(🔬)物体之后(hòu )，便开始(📿)对它进行研(yán )究(jiū )，后(hòu )(🏇)来(♑)有人重建(jiàn )出(⚫)来所谓的(👑)“神之(🗄)语言”，并建立(lì )电(diàn )脑(nǎo )程式以(yǐ )启动原始索哈尔，进行和上(🍮)位领域的U-DO(上位领域当中的(⏺)红色波动存在)连结的连结实(shí )验(yàn )，但很不(bú )(🦗)幸地，从上位领(lǐng )域流(liú )入下位领域的能(🤠)量造成了事象变移(💪)，使(shǐ )地球(🈴)(游戏中所谓(wèi )的“失(shī )落耶路撒(sā )冷”)几乎(🎋)完(wán )从(🕐)从宇宙中“消(xiāo )失”，人(rén )类因而被迫逃(táo )亡，离开地(dì )球。　　到了四千年多后，在(zài )故事(🤷)开始前十五的(de )T.C.4753年(nián )(🎥)，米尔(ěr )奇亚行星(Miltia)爆发了所谓的米(mǐ )尔奇亚(yà )冲突事件，在(👄)此次(cì )事件当中，米(🌸)尔(📞)奇亚行星(🎐)的人(rén )类疑似遭到(🎦)了格(gé )(🚻)诺西(xī )斯(Gnosis)的(de )攻(✖)击(🕺)，并在冲突事(🍹)件后消(❄)失，但事件的真相却因(🍯)为米尔奇(🈂)亚的消(🐱)失(🖱)而不为人知(⛅)。在(✒)事件后，启动原(yuán )始(shǐ )索哈尔（(♊)后来人类制造(🏆)出(🐣)了十二具索哈尔模拟体(tǐ )，因此原有的(🔝)索哈尔就(jiù )被称之为原始索哈尔(ěr )）所需(xū )的神之语言、原始索哈尔的研究成果、米尔奇亚的U.M.N.座(🏓)标(biāo )(⏩)等事(shì )物，都被封存(🏺)在(zài )Y资料当中(zhōng )，而Y资料又被(bèi )封存(💍)在(zài )(🌄)百式观(guān )测用合成人(Relian)M.O.M.O.的意(🤬)识内(nèi )，然而这(🈲)么(me )做却(🎆)引(yǐn )起了各方势力(lì )(🐊)对(duì )M.O.M.O.的争夺，因此(🚄)星团联邦(bāng )政府(📒)(游戏中统治各(gè )行星(xīng )的(💼)政(🗄)府，英(🎅)文(🚰)名(💻)Galaxy Federation)雇了(le )一(yī )个(gè )名(míng )叫Ziggurat 8的(de )生(🏃)化(huà )人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的(📑)安全。　　另一方(🐩)面(🗒)，在(☕)米尔(👑)奇亚冲突事(shì )(🍀)件(jiàn )结束后的十几年，也就是(shì )大(🎄)约在游戏EPI开始的时候(🍶)，当时最大的(de )企业贝克达公司以(yǐ )对(duì )抗(kàng )格诺西斯侵扰(📏)的名义，进行(háng )对格诺西(🔹)斯用战斗兵(🏐)器KOS-MOS的开发(🥗)计划，但和当(dāng )时多使用合(hé )成人(📌)(Relian)与(yǔ )生化(huà )人(Cyborg)的(🚁)情况所(suǒ )不同的(⚾)是，KOS-MOS是个纯粹的机械制品(🚲)。另一(🈁)方面，在(zài )EPI开(😛)始(♑)时，参与KOS-MOS开(🐢)发计划的贝克达(📃)公司第一(yī )开发局(jú )研(🔼)究(🕙)人员(yuán )卯(🚃)月紫苑，正乘(🛹)着(📿)当时(🥪)载(zǎi )有还没正式启动(🚒)的KOS-MOS的(❤)Woglinde号(hào )太空船(chuán )进行(háng )旅途(🖱)。但没想(🧦)到其太空(kōng )船(chuán )却被冲(chōng )著索哈(😄)尔而来的(de )格诺西(🏗)斯所(🐥)攻击，而(ér )KOS-MOS也(🎶)在此时(shí )(🐉)突然(🏾)启动，卯月(yuè )紫苑(yuàn )因而被卷(💝)入一(yī )(♌)连串和格(🌳)诺西(🤯)斯及(jí )索(suǒ )哈尔有关的阴谋，以及(jí )会改变(🌂)人类命运的(🕝)事件当中……(🥇)