自西元20XX年，人类从肯(📒)亚图(tú )尔卡(🔼)纳湖(🃏)的湖(hú )(😘)畔挖(wā )出了一个名(🤴)叫索哈尔(🎗)(Zohar)的物体之(🐮)后，便(😧)开始对(🌫)它(tā )进行研究(jiū )，后来有人重(🚤)建出来所谓的(de )“神(🤷)之语言”，并建立电(✳)脑程式以启动原始索(🛺)哈(hā )(📞)尔，进行和上位领域的U-DO(上位领域当(dāng )中的红(🚢)色波动存在)连结的连结实验(yàn )，但很(💱)不幸地，从上位(wèi )领(💻)域流入下(🔝)位(wèi )领(lǐng )域的能量(liàng )造成了(le )事象变移，使地球(游戏中所谓(wèi )的“失落耶路撒(sā )冷”)几乎完从(cóng )(🕐)从宇宙中“消失”，人(rén )类因而被(bèi )迫逃亡，离开(👊)地球。　(🐾)　到(😊)了(le )四千年多后，在(👪)故事开始(shǐ )前十五(wǔ )的T.C.4753年，米(🈺)尔(🤔)奇(📧)亚行星(Miltia)爆发了所(suǒ )谓的(🍽)米(🏃)尔奇亚(yà )冲(chōng )突(tū )事件，在(👄)此(🐖)次事(🖍)件当(dāng )中，米尔奇亚(yà )行星的人(rén )类疑似遭到了格(gé )(🚻)诺(nuò )西(🔪)斯(Gnosis)的攻(gōng )击，并在(😉)冲突事件(jiàn )后消(xiāo )失，但事件的真相却(què )因为(wéi )米尔(ěr )奇亚的消失而不(bú )为人知。在事件后，启动原始(shǐ )(🎞)索哈尔(ěr )(🐇)（后来人类制造(zào )出了十(shí )二具(⛎)索哈(hā )尔模拟(nǐ )体，因此原有的索(🦐)哈(🏁)尔就被称之为原始索(🖥)哈(😂)尔）所需(xū )的神之语(yǔ )言(📸)、原始索(🏒)哈尔(🎆)的研究(jiū )成果、米尔奇亚的U.M.N.座标等(🤳)事物，都(📛)被封存在(zài )Y资料(liào )当中，而(⛄)Y资料又被封存在(zài )百(🔭)式观(guān )测用合(hé )成人(Relian)M.O.M.O.的意识(shí )(🚖)内，然而这(zhè )么做却引起了各方势(shì )力(🐊)对M.O.M.O.的争夺(duó )，因此星团联邦政府(fǔ )(游戏(xì )中统治各(gè )行星的政(zhèng )(🗄)府(fǔ )，英文名(💻)Galaxy Federation)雇了(le )(😓)一(yī )个名(míng )叫Ziggurat 8的生(🏃)化人(rén )(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全(quán )。　　(🧜)另一方面(🗒)，在米尔(ěr )奇亚冲(chōng )(💦)突事件结束后的(de )十(shí )几年，也(yě )就(👚)是大约在游戏(🐺)EPI开始的时(shí )候，当(🚮)时最大(📊)的企业(🏜)贝(🔅)克达公(gōng )司以对抗格诺西(🧢)斯侵扰(rǎo )的名义，进行对格(📐)诺西斯用(yòng )(😞)战斗兵器KOS-MOS的(🧤)开发计划(🔨)，但和(🀄)当时多使用合成人(Relian)与生(🐂)化人(Cyborg)的(de )情(🚠)况(kuàng )所(suǒ )(🛹)不(🗂)同的(de )是(✡)，KOS-MOS是(shì )个(🈷)纯粹的机械制品。另一方面(🤣)，在EPI开始(♑)时(🔋)，参与(yǔ )KOS-MOS开发计(🛴)划的(🧔)贝克达公(gōng )司第(🗝)一(😿)开(kāi )发(fā )局研究人员(yuán )卯月(yuè )紫苑，正乘着(📿)当时载(🐕)有还没(🧀)正式(⬇)启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行旅途。但(♟)没想到其太空船却(🏺)被冲著索(✨)哈尔(😙)而(ér )(👫)来的(de )格诺(📎)西(xī )斯所(🐥)攻(gōng )击，而KOS-MOS也在此时突(tū )然启动(dòng )，卯月紫苑(🌭)因而被卷入一连串和格诺西斯及索哈(👲)尔有关(⏺)的阴谋，以及会改变(🌂)人类(lèi )命(mìng )运的事(🆔)件当中……(🥇)