自西元(yuán )(🍅)20XX年(⛲)，人类从肯亚图尔卡纳(nà )湖(hú )的湖畔挖(wā )出了一(🕰)个名叫索哈尔(Zohar)的物体之后(hòu )，便开始对它进行研究，后来(lái )有人重(chóng )建出来所谓的(👑)“神之语言”，并建立电脑(🔲)程式以启(qǐ )动(🚥)原始索(suǒ )(🛺)哈(📞)尔，进(jìn )行(háng )和上位(✖)领域的U-DO(上位领(lǐng )(🐖)域(🤷)当中的红色波动存(cún )在)连(lián )结的连结实验，但(❔)很不幸地，从上位领域流入下(xià )位领域的能(🤠)量(🤸)造成了(㊙)事象变移，使地(⏰)球(游戏中所谓(🧤)的“失落耶(⛳)路撒冷”)几乎完(wán )(🥕)从(🕐)从宇宙中“消失”，人类因而被(💝)迫逃亡，离开(kāi )地(dì )球(qiú )。　(🐾)　到了(le )四(sì )千年多后，在故事(shì )(🤷)开始前(💅)十五的(💹)T.C.4753年，米尔(ěr )奇亚行星(Miltia)爆发了(💸)所谓的米(🏃)尔(🔞)奇(🏴)亚冲突事(🌂)件，在此次(🆙)事件当中，米尔奇(⏳)亚行(háng )星的(de )(🍁)人(rén )(🔲)类疑(🕕)似(sì )遭到(dào )了格诺西斯(🐂)(Gnosis)的攻(✖)击，并(bìng )在冲突事(shì )件后(hòu )消(xiāo )失，但(dàn )(⏺)事件的(de )真相却因为米(🌲)尔奇亚的消(xiāo )失而不为人知。在(zài )事件后(🙅)，启动(dòng )原始索哈(hā )尔（后(hòu )来(🔍)人(🏗)类制(🗒)造出了(le )十二(èr )具索(🏖)哈尔模拟体，因此原有的索哈尔(🍏)就(😻)被(bèi )称之为原(🤠)始索哈尔）(👡)所(suǒ )(👧)需(🐼)的神(shén )之(zhī )语(🖥)言(📸)、原始(👅)索哈尔的研(yán )究成果、米(mǐ )尔奇亚的U.M.N.座标(biāo )等事(shì )(🔡)物，都(dōu )被封存在Y资料当中，而Y资料又被封存在(🌄)百(bǎi )式观测(cè )用(yòng )(😫)合成人(🛒)(Relian)M.O.M.O.的(de )意识内，然而这(zhè )么做却引起了各(🔦)方势力对(duì )(📻)M.O.M.O.的争夺，因(🚹)此星团联邦政府(fǔ )(游戏(xì )中统治(zhì )各(⤴)行星(👂)的政府，英(🎅)文(wén )名Galaxy Federation)雇(gù )了一个名叫Ziggurat 8的生化(huà )人(rén )(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全。　(😇)　另一方面，在米尔(👑)奇亚(🤼)冲突事件结束后的十几年，也就是大(🎄)约在游戏(xì )EPI开(👮)始的(de )时候(🍶)，当时最大的(de )企(qǐ )(🚔)业贝克(🛀)达公司以(👻)对抗(kàng )格(🔢)诺西(🧢)斯(sī )侵扰的名义(yì )，进(✉)行对格诺(nuò )西斯用战斗兵器KOS-MOS的(de )开发计(jì )划，但和当时多使用合成(🙂)人(Relian)与生化(huà )人(📰)(Cyborg)的情况(🗣)所不同的是，KOS-MOS是个(🈷)纯(chún )粹的机械(xiè )(🍺)制(zhì )(🔰)品。另(lìng )一方面，在(zài )EPI开始时(shí )，参与KOS-MOS开发计划的贝克(kè )(🙊)达公司第(dì )一开(kāi )发局研(yán )究人(😯)员卯月紫苑，正乘着当时载有还没正式启动(🚒)的KOS-MOS的Woglinde号太空(🧛)船进行(💍)旅途。但没想到其太空船却被冲(chōng )著索哈尔(ěr )而来(💝)的格(gé )诺西(xī )斯所攻(gōng )击(jī )(🦖)，而(ér )KOS-MOS也在(🥚)此时(shí )突(🏳)然启动，卯(mǎo )月紫苑因(🍙)而被卷(💝)入一(yī )连串和格诺(㊙)西斯及(📈)索哈(hā )尔有关(guān )的阴谋，以(🕗)及会(♊)改变(biàn )(🌂)人(✖)类命运的事件(jiàn )当中(zhōng )(🙂)……